垦荒作为一种方式却不可能推广到全国各个角落，对于那些无荒可垦的土地就需要依靠屯田制。
屯田作为明朝的一项重要的农业经济措施，洪武年间特别颁布的《军士屯田则例》就对屯田军士的任务、时间、屯田的数额、赋税等问题都进行了规定。在之后的建文朝、永乐朝也都规定了相关的屯田条例。明初《军士屯田则例》的颁布，对于全国范围内屯田面积的增长，发挥了重要的作用，客观上刺激了军士屯田的积极性。
有人垦荒，有人屯田，那么这些人都垦了多少亩的荒地？那些人又屯了几亩的田地？这些问题就需要依靠土地清册来解决。历代来说丈量全国土地进行清册都是一项艰巨的任务，尤其是对于一个新的朝代，刚从战乱中统一正在恢复的朝代来说更是如此。不仅是官方的土地账册不知所踪，原本居于此地的百姓也是四散逃离，所以明朝便决定重新丈量土地整理造册。土地的清册是政府在丈量土地基础上制定的田亩清册，因为图中所绘排列如鱼鳞，所以叫作“鱼鳞图册”。鱼鳞图册在宋元时期已经作为土地清册而存在，在明朝时，鱼鳞图册形成于洪武二十年（公元1387年），是朱元璋诏命国子监巡行全国各州县，对土地进行清丈，勘实田亩。对于类似坟地、山地、沙漠荒地、盐碱地这些不能作为耕地的土地也分别进行了注明。